Una reciente sentencia del Alto Tribunal aclara el alcance del efecto preclusivo del procedimiento de comprobación limitada.

El pasado 12 de marzo de 2025, el Tribunal Supremo dictó una importante sentencia (STS 270/2025, Rec. Cas. 2349/2023) que consolida una doctrina clave en materia tributaria: la Administración no puede volver a revisar un mismo concepto impositivo y periodo si ya ha sido objeto de comprobación limitada, salvo que concurran hechos nuevos.

El caso: dos comprobaciones sobre el mismo objeto

En la sentencia se analiza el caso de una sociedad que, tras haber recibido una liquidación provisional dentro de un procedimiento de comprobación limitada respecto al Impuesto sobre Sociedades (IS) del ejercicio 2016, fue nuevamente objeto de revisión por parte de la Inspección, que concluyó eliminando las bases imponibles negativas aplicadas.

La Inspección argumentó que, en ese nuevo procedimiento inspector, se había detectado que dichas bases ya habían sido anuladas en ejercicios anteriores. Sin embargo, el Tribunal Supremo rechaza esta justificación, subrayando que la información estaba ya disponible durante el primer procedimiento, y que, por tanto, no se trataba de hechos nuevos ni de actuaciones distintas.

Doctrina fijada por el Tribunal Supremo

El Alto Tribunal deja claro que el artículo 140.1 de la Ley General Tributaria (LGT) impide a la Administración volver a regularizar un mismo objeto tributario si ya ha sido examinado mediante un procedimiento de comprobación limitada, a menos que se descubran hechos o circunstancias nuevas, derivados de actuaciones distintas.

En este caso, las dos actuaciones —comprobación limitada e inspección— se centraban en el mismo elemento (i.e. la compensación de bases imponibles negativas) y en el mismo periodo (i.e. IS del ejercicio 2016), y no se acreditaron nuevos hechos. Por tanto, el Alto Tribunal declara que no era conforme a Derecho una segunda regularización sobre el mismo objeto, anulando así la liquidación practicada por la Inspección.

Relevancia para los contribuyentes

Esta sentencia constituye un importante respaldo a la seguridad jurídica de los contribuyentes. Reitera que la Administración tributaria no puede revisar de forma sucesiva y sin causa debidamente justificada una obligación ya comprobada.

La sentencia también pone en valor el principio de buena administración y el derecho del contribuyente a que las actuaciones de la Administración se desarrollen con previsibilidad y coherencia.

Conclusión

La sentencia del Tribunal Supremo de fecha 12 de marzo de 2025 (STS 270/2025, Rec. Cas. 2349/2023) representa una garantía para empresas y profesionales frente a posibles excesos en las potestades de comprobación e inspección de la Agencia Tributaria. Refuerza asimismo el valor jurídico del procedimiento de comprobación limitada y evita que se convierta en un trámite meramente preliminar o revisable a conveniencia.

Desde Rosillo Tax & Legal celebramos esta consolidación doctrinal, que incide directamente en la protección de los derechos del contribuyente y la correcta aplicación del principio de legalidad tributaria.